Le suivi écologique est un volet faisant partie du plan d'aménagement et de gestion du Parc Régional W/ECOPAS. il est logé dans le plan de travail annuel (PTA)  de la direction du Parc W/Bénin. Dans ce secteur sont prévu plusieurs activités concernant à la fois l'intérieur et l'extérieur de cette Aires protégée. Au nombre des activités relevant du suivi écologique, nous citons le dénombrement de la faune. Cette activité a été réalisée conjointement avec la composante Niger du Programme ECOPAS dans un esprit de la régionalité et dans un cadre d'harmonisation d'une base de données commune aux trois composantes du programme. Le nombre de secteur couvert par la présente édition est resté conformes à ceux des trois dernières années antérieures avec un ajout de cinq nouveaux secteurs. Ceci a permis d'amélioré le pourcentage de la superficie couverte par l'inventaire. Ainsi 10 zones ont concernés ce dénombrement. Il s'agit de:  

• La zone de chasse de la Mékrou 
• La zone sud-Ouest du Parc ayant la forme d'un triangle
• La zone comprise entre Koudou et le point triple dans le Parc (zone Zapingou)
• La zone cynégétique de la Djona.
• La zone de la mare 25,
• La zone de Barabo
• La zone de Bangoutchiré,
• La zone du point triple­
• La zone de sikoka 
• La zone de sakanin-Kofoni